终末消毒是指传染源住院、转移、死亡而离开疫点或终止传染状态后，对疫点进行的一次彻底消毒。在医院就是患者出院后对其所停留的病房进行彻底清洁消毒，以达到安全的目的，降低后续患者入住该病房后感染的风险。
一、空气消毒
开窗通风至少30分钟，加强空气流通。
1.普通病区：有人情况下可采用移动式空气消毒机，无人情况下使用紫外线灯消毒。
2.发热门诊、隔离病房及感染病区：选用空气消毒机至少2小时（紫外线消毒1小时）。
二、患者污染物处理
1.少量污染物可用一次性吸水材料(如纱布、抹布等)沾取2000mg/L的含氯消毒液(或能达到高水平消毒的消毒湿巾/干巾)小心移除，移除后，再按照消毒流程处理。
2.大量污染物应使用含吸水成分的消毒粉或漂白粉完全覆盖，或用一次性吸水材料完全覆盖后用足量的2000mg/L的含氯消毒液浇在吸水材料上，作用30分钟以上，小心清除干净。清除过程中避免接触污染物，清理的污染物按医疗废物集中处置。患者的排泄物、分泌物、呕吐物等应有专门容器收集，用含有效氯2000mg/L含氯消毒剂，按粪、药比例1:2浸泡消毒2h。清除污染物后，应对污染的环境物体表面进行消毒。盛放污染物的容器可用含有效氯2000mg/L的含氯消毒剂溶液浸泡消毒30分钟，然后清洗干净。
三、 物表消毒
1.普通病区：诊疗设施、设备表面以及高频接触卫生表面，如床栏、床边桌、呼叫按钮、监护仪、微泵、门把手等物体表面有肉眼可见污染物时，应先完全清除污染物再消毒。无肉眼可见污染物时，用500mg/L的含氯消毒液进行擦拭消毒，作用30分钟后清水擦拭干净。
2.发热门诊及感染病区：使用含有效氯1000mg/L的含氯消毒液进行喷洒、擦拭或浸泡消毒，作用30分钟后清水擦拭干净。其余处理同普通病区。
四、地面消毒
1.普通病区：有肉眼可见污染物时应先使用一次性吸水材料完全清除污染物后消毒。无明显污染物时可用500mg/L的含氯消毒液擦拭消毒。
2.发热门诊及感染病区：有肉眼可见污染物时，应先完全清除污染物再消毒。无肉眼可见污染物时，可用1000mg/L的含氯消毒液擦拭或喷洒消毒。
五、卫生间消毒
卫生间便器内使用2000mg/L的含氯消毒剂或漂白粉作用30分钟，需要关上便器盖子再冲厕，如开放性便器，则在消毒剂作用后放置两张卫生纸后再冲厕，整个过程做好手卫生。
六、复用物品消毒
复用的诊疗器械、器具应当尽量选择一次性使用的诊疗用品。发热门诊及感染病区的听诊器、温度计、血压计等医疗器具和物品实行专人专用。重复使用的医疗器械、器具使用含有效氯1000mg/L的含氯消毒液浸泡至少30分钟（普通病区不需要浸泡消毒），双层医疗垃圾袋密闭运送至消毒供应中心处理，并做好“新冠特殊病原体”标记，运送前加套一层医疗垃圾袋或使用含有效氯1000mg/L的含氯消毒液喷洒外包装。
七、织物消毒
1.患者用过的床单、被套、枕套等织物使用后1000mg/L的含氯消毒液浸泡至少60分钟（普通病区不需要），双层医疗垃圾袋密闭封存，做好“新冠感染性织物”标识，通知洗涤公司回收，回收前加套一层医疗垃圾袋或使用含有效氯2000mg/L的含氯消毒液喷洒外包装，洗涤公司严格按照规范进行清洗、消毒。出院患者（此患者指疑似或确诊新冠肺炎患者）贵重衣物可选用环氧乙烷方法进行消毒灭菌处理。
2.医护人员的复用织物（如复用隔离衣、工作服等）使用后1000mg/L的含氯消毒液浸泡至少30分钟，双层医疗垃圾袋密闭封存，做好“新冠感染性织物”标识，逐区传递至织物回收点，通知洗涤公司回收，回收前加套一层医疗垃圾袋或使用含有效氯2000mg/L的含氯消毒液喷洒外包装，洗涤公司严格按照规范进行清洗、消毒。
八、医疗废物的管理
患者所有的废弃物应当视为感染性医疗废物，严格依照《医疗废物管理条例》和《医疗卫生机构医疗废物管理办法》、《转发国家卫生健康委办公厅关于做好新型冠状病毒感染的肺炎疫情期间医疗机构医疗废物管理工作的通知》管理，要求双层封扎，运出污染区前再加套一层黄色医疗废物袋/外包装喷洒2000mg/L含氯消毒液，“新冠”标识清楚、密闭转运，一旦外包装有污染加套一层黄色医疗废物袋。
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